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PubMed

In der frei zugänglichen Artikeldatenbank PubMed werden über 5000 internationale (vorrangig englischsprachige) biomedizinische Zeitschriften ausgewertet. Die Suchsprache ist Englisch. Alle nicht-englischsprachigen Titel sind übersetzt.

Besonderheiten:

  • Verschlagwortung der meisten Artikel mit Medical Subject Headings (MeSH) und gegebenenfalls automatische Suche mit MeSH-terms in Hintergrund, siehe Abschnitte "Suchmöglichkeiten" und "Thematische Suche mit MeSH".
  • Bitte benutzen Sie immer die spezielle Einstiegs-URL unserer Bibliothek für Ihre Suche (auch als Link oder via Direktsuche auf unserer Homepage). Hierdurch werden der "Check full text"-Service (siehe unten) eingebunden, zusätzliche Ergebnisfilter rechts angezeigt (z. B. Review, Clinical Trial, German) und die Suchbegriffe in den Treffern gelb hervorgehoben.

Suchmöglichkeiten

Standardmäßig werden alle nebeneinander eingegebenen Begriffe in allen Suchkategorien gesucht (jeder Begriff muss gefunden werden), aber es wird gegebenenfalls im Hintergrund mit verknüpften thematischen Begriffen (MeSH-terms) gesucht, das ist sichtbar in der Search details-Box in der rechten Spalte der Ergebnisseite, siehe Screenshot nach der Suche mit prostate cancer:

Generell sind Suchstrings mit OR-Verknüpfungen, Klammern und Platzhalter (* für 0-n Zeichen rechts) möglich, z. B. term1 (term2 OR term3*). Phrasen (genaue Wortfolge) können mit Anführungszeichen gesucht werden ("term term").

 Hinweis: Die automatische Suche mit MeSH-terms wird verhindert wenn man mit Platzhalter oder Phrasen-Anführungszeichen sucht.

Für Fortgeschrittene: Feldkennungen und Advanced-Suchmaske

Über Feldkennungen hinter jedem Begriff oder jeder Phrase kann man vorgeben, in welchem Feld gesucht werden soll, z. B. term[ti] im Titel oder "term term"[tiab] in Title, Abstract und Author Keywords – allerdings wird dann nicht mehr automatisch nach MeSH-terms gesucht.

Die Suche mit Feldkennungen funktioniert komfortabel über die Advanced-Suchmaske, z. B.  nach Journal (auch Eingabe von Abkürzungen möglich). Show index list zeigt die Anzahl der Treffer an. Siehe Screenshot und Tutorial.

Über die dortige History können Sie vorherige Suchschritte nochmal ausführen oder über Add und Edit verändern.

 Hinweis: Bei Auftragsrecherchen kombinieren wir in der Regel MeSH-terms und Title/Abstract-Begriffe je Suchaspekt.

Filter

Das Filter-Menü auf der linken Seite der Ergebnisliste ermöglicht das Einschränken der Suche nach bestimmten Kriterien, wie z.B. Publikationsdatum und -typ, Sprachen, Altersgruppen, Geschlecht etc. Über Show additional filters können standardmäßig nicht angezeigte Filter ausgewählt werden. Über clear werden Filter wieder gelöscht. Siehe Tutorial

Von uns eingebundene Filter (rechts angezeigt) müssen nach der Benutzung nicht gelöscht werden.

Im Filter Journal categories (siehe Screenshot) gibt es mehrere nützliche Einträge: mit Core clinical journals schränkt man auf Artikel aus rund 120 Top-Zeitschriften ein, MEDLINE zeigt nur mit MeSH-terms verschlagwortete Artikel an, und Nursing journals schränkt ein auf ca. 185 Pflegezeitschriften.

 Hinweise: Filter wie Species, Sex, Ages und Article types schränken automatisch auf bereits verschlagwortete Artikel ein, da sie Teil der Verschlagwortung sind. Der Article type Systematic Reviews ist als komplexe Suchstrategie eine Ausnahme – siehe auch die Abschnitte "Clinical Queries" und "PubMed Health". Der Sprachfilter Languages bezieht sich immer auf alle Artikel.

Ergebnisanzeige und Export

  • Anzeige und Similar articles

    Jeder Treffer führt über den verlinkten Titel zur Detail- bzw. Abstractanzeige. Dort gibt es meist ein englischsprachiges Abstract, die Author information (seit 2014 für alle Autoren, davor nur für den Erstautor), Author Keywords, und gegebenenfalls aufklappbare Publication types und MeSH terms (siehe Screenshot).

    Eckige Klammern um den übersetzten Titel bedeuten, dass die Originalsprache  des Artikels nicht englisch ist, die Sprache wird bei der Zeitschrifteninformation angezeigt, siehe Screenshot.

    Sortierung: standardmäßig sind die Treffer chronologisch sortiert (neueste zuerst), das kann jedoch umsortiert werden, z. B. nach Best Match (Treffermenge kann leicht abweichen). Das Anzeigeformat kann auf Abstract umgestellt werden, siehe Screenshot.

    Die Similar arcticles-Funktion unterhalb der PubMed-ID (PMID, eindeutige Nummer für jeden Artikelnachweis, der auch für die Suche genutzt werden kann) führt zu 50-150 ähnlichen Treffern in Bezug zum ausgewählten. Sind im ausgwählen Artikel MeSH-terms vorhanden, ist das von Vorteil.

  • Export und Merkliste

    Über Send to können Treffer exportiert werden, z. B. für EndNote mit der Auswahl Citation manager (max. 200) oder alle mit File > Format MEDLINE, siehe Screenshot. Wenn Sie einzelne Treffer vorher anhaken bezieht sich Send to auf diese Auswahl. Clipboard ist die Merkliste.

Clinical Queries

Auf der Seite Clinical Queries (siehe auch PubMed-Homepage unter PubMed Tools) kann man unter Clinical Study Categories nach Abschicken der Suchbegriffe auf die Studienkategorien Therapy, Diagnosis, Prognosis, Clinical prediction guides, Etiology einschränken, und zwar jeweils Broad oder Narrow, siehe Screenshot.

Auf der gleichen Seite gibt es auch die Filter Systematic Reviews (basiert auf einer Suchstrategie, siehe auch Filter-Menü) und Medical Genetics mit Unterbegriffen zur weiteren Einschränkung.

Die ausformulierten Suchstrategien für diese Filter sind verlinkt.

Thematische Suche mit MeSH

Zur thematischen Suche können englischsprachige Schlagworte (Medical Subject Headings) genutzt werden.

 Hinweis: Aktuelle Artikel sind noch nicht verschlagwortet (kann im Einzelfall bis zu 6 Monaten dauern) und epubs ahead of print gar nicht.

  • MeSH in der Abstractanzeige

    Experten der National Library of Medicine vergeben auf Grundlage des Volltextes Schlagworte, die in der Abstract-  bzw. Detailanzeige aufgeklappt werden können, siehe Screenshot. Der Artikel ist dann [Indexed for MEDLINE]. Die Kategorien humans/animals und male/female werden immer vergeben. Die thematischen Begriffe können bestimmte Unterbegriffe enthalten, sogenannte Subheadings, die nach dem Schrägstrich stehen. Ein * am Ende bedeutet, dass dieser Begriff ein Hauptaspekt der Arbeit ist (Major topic).



  • MeSH database

    Über die Startseite der MeSH database (siehe auch Pubmed-Homepage unter More Resources) kann man gezielt nach diesen Begriffen suchen, die hierarisch als Baumstruktur angelegt sind.

    Die Suche mit prostate zeigt als 4. Treffer Prostatic Neoplasms an, siehe Screenshot. Oft ist die Suche mit Platzhaltern sinnvoll, hier z. B. mit prostat*.

    Nach Auswahl werden zahlreiche Subheadings anzeigt (passende Auswahl aus rund 80 möglichen, siehe https://www.nlm.nih.gov/mesh/subhierarchy.html), die eine engere Suche ermöglichen.

    Darunter ist folgende Auswahl möglich:

    Die Einschränkung auf Major Topic bedeutet: finde nur Artikel, wo der MeSH-term ein Hauptaspekt der Arbeit darstellt (Suche mit term[majr]).

    Der zweite Punkt verweist auf die MeSH-Hierarchie, die dann weiter unten angezeigt wird (ein oder mehrere Bäume mit verlinkten Begriffen zum browsen): standardmäßig werden alle Begriffe unterhalb eines MeSH-terms für die Suche verwendet, außer man schließt das hiermit explizit aus (term[mesh:noexp]).

    Der MeSH-term kann über die Search Builder-Box für die Suche verwendet werden, siehe Screenshot.

    Die dann folgenden Entry Terms sind Synonyme, bei deren Verwendung automatisch mit dem zugehörigen MeSH-term gesucht wird. Sie dienen auch zur Hilfestellung bei der Suche nach Title/Abstract-Begriffen.

    Achten Sie auf Year introduced oben bei der Definition und gegebenenfalls Previous Indexing unterhalb der Entry Terms - manchmal ist es sinnvoll auch mit vorherigen MeSH-terms zu suchen.

     Hinweis: Auf PubMed Online Training sind ein Tutorial und kurze Videos zur Verwendung von MeSH vorhanden. 

Alternative PubMed-Tools

Im Internet gibt es eine Vielzahl von Tools die auf der Datenbank PubMed basieren und die Suchergebnisse visuell darstellen und/oder statistisch aufbereiten. Eine Auswahl:

  • PubReMiner: Hiermit können detaillierte statistische Analysen erstellt werden, z.B. zu Experten eines Fachgebiets oder Zeitschriften in welchen häufig zu einem bestimmten Thema publiziert wird.
  • BibliMed: Suchoberfläche für Medline, die den Suchprozess unterstützt. So werden nach Eingabe eines Begriffs MeSH-Begriffe und Zeitschriften vorgeschlagen, die für das Thema relevant sind. Im weiteren Verlauf kann die Suche mit weiteren MeSH-Begriffen noch mehr eingegrenzt werden.

PubMed Health (Portal)

Das Informationsportal PubMed Health legt den Fokus auf die klinische Effektivität von medizinischen Interventionen. Wichtigste Ressource hierfür sind Systematische Reviews (Übersichtsarbeiten), welche die Qualität klinischer Studien und deren Ergebnisse bewerten und zusammenfassen.

Ziel und Zielgruppe

Ziel des Portals ist die Zusammenführung Systematischer Übersichtsarbeiten verschiedener Organisationen und weitere Quellen der evidenzbasierten Medizin unter einer Suchoberfläche. So werden sowohl Zusammenfassung von Systematischen Reviews als auch ausführliche HTA-Berichte und Leitlinien im Volltext angeboten. Ergänzt wird das Angebot durch ein Nachschlagewerk und Medikamenteninformationen.

Das Portal ist sowohl für Patienten als auch im Gesundheitswesen Tätige konzipiert, somit lässt es sich nicht eindeutig von Clinical Queries (Zielgruppe: Ärzte) und Medline Plus (Zielgruppe: Patienten) abgrenzen.

Weitere Informationen

  • siehe PubMed Health Help und About
  • ein vergleichbares Angebot aus Großbritannien ist das Portal NHS Evidence

My NCBI-Konto und E-Mail-Alerts

My NCBI ist ein kostenloses Konto, das mit PubMed verbunden ist. Neben dem Anlegen einer eigenen Bibliografie ermöglicht es auch das Anlegen von E-Mail-Alerts. So können Sie sich nach dem Abspeichern einer Suchanfrage regelmäßig über neue Einträge in PubMed zu Ihrer Suchanfrage informieren lassen.

Ausführliche Informationen zur Nutzung des MyNCBI-Kontos enhält My NCBI Help.

Hinweis: My-NCBI-Nutzer sehen den "Check full text"-Button  nur bei aktiviertem Outside Tool:

 Sign In > NCBI Site Preferences > PubMed Preferences > Outside Tool anklicken > Bibliothek der Medizinischen Fakultat Mannheim auswählen > Save

Zugriffshinweise und "Check full text"-Service

Nutzen Sie den "Check full text"-Service über den Button  in der Abstract- bzw. Einzeltrefferansicht, um Volltexte abzurufen oder über den Literatur-Liefer-Dienst zu bestellen.

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